2000年，東元電機總部從臺北市中山區(qū)松江路“東元大樓”遷入臺北市南港區(qū)南港軟件工業(yè)園區(qū)，另成立臺灣宅配通。2001年，東元電機成立東元激光科技，生產(chǎn)電致發(fā)光顯示器ELD。2002年，東元電機發(fā)表新版企業(yè)識別系統(tǒng)CIS，啟用第二代商標；東元集團整合為六大事業(yè)群。2003年，東元電機正式合并臺安電機，“無錫東元電機”正式啟用投產(chǎn)。2004年，東元電機成立“江西東元電機有限公司”。2005年，東元電機與安川電機合資于日本福岡縣北九州市成立東元安川馬達。2005年3月6日，東元電機董事長黃茂雄在東元電機2005年經(jīng)銷商大會上宣布成立安悅電氣，定位為社區(qū)型3C通路，是臺灣第一個以加盟連鎖方式推廣的3C通路。2005年5月17日，菱光科技股票上市。2006年，東元電機取得伊萊克斯?jié)L筒洗衣機臺灣總代理權，東元電機成立“安臺創(chuàng)新科技廈門有限公司”，江西東元廠區(qū)落成啟用。2007年，東元電機成功研發(fā)2MW風力發(fā)電機，另成立“福建東元精工有限公司”與“青島東元精密機電有限公司”。

臺灣東元電機目前是臺灣最大的重電廠商，目前營收為馬達及電控等重電業(yè)務貢獻超過七成，家電占二成，同時為臺灣高鐵公司與遠通電收的發(fā)起股東之一。東元電機前任董事長黃茂雄在林長城治喪禮拜儀式說：“林長城過去在東元擔任廠長時，雖然被東元員工稱為‘閻羅王’；不過林長城過去以來，對員工所樹立‘品質第一、交期第二、價格與獲利第三’的要求，才會造就東元今日‘馬達王國’的地位。”