西漢時屬益州郡，東漢時屬永昌郡，蜀漢時屬云南郡，唐初屬陽瓜州，南詔時屬蒙舍賧，宋時屬天水郡。元忽必烈至元十二年（1275年）始建縣，稱名定邊縣，屬鎮(zhèn)南州。至元二十四年(1287年)革定邊縣改為鄉(xiāng)，仍屬鎮(zhèn)南州。明洪武十七年（1384年）復(fù)置定邊縣，屬楚雄府。清雍正七年(1729年)裁定邊縣，歸蒙化府。民國屬蒙化縣。中華人民共和國成立后,1950-1960年屬巍山縣。1961年10月由巍山縣分出籌建南澗縣。1963年9月，經(jīng)國務(wù)院批準設(shè)立南澗縣，1965年11月27日成立南澗彝族自治縣。

    “十五”以來，南澗縣進一步加大交通基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)力度，強化交通行業(yè)管理，交通狀況不斷改善。目前，縣鄉(xiāng)公路等級不斷提高，境內(nèi)公路總里程達2469公里，所有行政村通公路，村組公路通路率達87%。馬安、巍南、岔小公路建設(shè)工程全面完工，公民、沙樂、無量等一批縣鄉(xiāng)彈石路建設(shè)全面完工；建成了兩個農(nóng)村五級客運站和3個碼頭�？奎c；新修村組公路830公里；投資2614萬元的農(nóng)村公路通達、通暢工程建設(shè)進展順利。基本形成了以過境干線公路為骨架，縣鄉(xiāng)公路為脈絡(luò)，鄉(xiāng)村道路相連通的交通網(wǎng)絡(luò)，便利的交通，有力地促進了南澗縣經(jīng)濟社會的全面發(fā)展。境內(nèi)交通基礎(chǔ)設(shè)施的改善，促進了道路運輸業(yè)的快速發(fā)展。全縣8個鄉(xiāng)鎮(zhèn)均開通了客運班車，縣城開往各地的客運車輛中巴車日發(fā)班次達121次，已統(tǒng)一規(guī)范進站、從事旅客運輸經(jīng)營的微型車95輛，客運市場日益活躍；境內(nèi)“四線一站”工程的實施，加快了物流周轉(zhuǎn)運輸，貨運事業(yè)蓬勃發(fā)展，擴大了南澗對外宣傳和開放的力度，交通運輸經(jīng)濟日趨繁榮。